摘要:
本研究將以台日共同發表學術論文為分析主軸，透過台日雙邊共同發表論文的數量、績效、合作模式與型態，勾勒歷年台日學術合作的樣貌，藉以掌握台日國際學術合作的發展趨勢。分析資料來源為SCI 和SSCI資料庫，觀察期間涵蓋1991-2008年。
相對於本計畫項下於2006年所進行的「台日學術國際合作分析－以台日共同發表論文為例」之研究，在方法上，除將樣本觀察期間延伸至2008年之外，在研究內容方面另擴充至跨國比較分析，透過比對台灣與其他國家（美國、中國以及歐盟國家）的跨國合作表現，評估台日共同合作論文的定位。另外，對於台日兩國學、研、產之間合作機構類型的探討，不僅鎖定於雙邊強勢學門合作模式的物理學，還將觸角延伸至雙邊弱勢合作模式的地球科學，以及日本強台灣弱合作模式的化學。本年度研究主要有以下重要發現： 在 1991-2008 年間，台日學術合作發表論文有逐年緩慢攀升的現象。在跨國比較中可知，台灣論文發表的合作伙伴朝向多元化發展，以美國為主的合作模式已逐漸減少，慢慢擴展與其他國家（包括日本、中國、歐盟）的合作。其中，台日合作的發表論文居冠。
在論文績效表現方面，台日合著論文的被引用次數較高，表現優於台灣獨自發表論文。在跨國比較觀點，台日共同發表論文在數量居冠，但整體被引用次數的表現卻略低於台歐合著論文。以細部學門來看，生物與生化學、物理學、太空科學以及臨床醫學是台日共同論文表現一直優於台灣獨自發表；電腦科學、地球科學、免疫學、數學、分子生物與遺傳學與精神病學與心理學等學門，在樣本觀察期間，台日學術表現有逐漸提昇，超越台灣獨自發表論文之表現。其中，台日共同發表論文表現最為優異的學門是物理學 (Physics)，被列為高度被引用的文獻共達74篇。
關於台日雙邊合作模式，挑選前11大台日之間學術合作論文學門進行分析。分析發現物理學與材料科學為雙邊強勢學門的合作；地球科學學門 (Geosciences)為雙邊弱勢學門的合作模式；生物與生化、化學為日本強台灣弱的合作模式。
分析台日兩國學、研、產之間合作機構類型，多數仍以大學與研究單位為主，合作類型亦以台日雙邊的大學與研究機構所組成的研究團隊占大宗。此外，台日合作發表論文還增加了與產業界的合作機會，整合台日之間學研機構一同交流合作，反映近年來台日兩國提倡產學合作的趨勢。其中，物理學的合作團隊規模最大，且有穩定的固定合作伙伴。
從上述研究可推論，未來台日之間具有發展潛力的合作學門，除了量與質上一直都有不錯表現的物理學，以及借鏡日本強勢的化學、臨床醫學與生化學門之外，地球科學學門的快速成長，也可為未來台日學術合作的主要方向之一。