租稅制度是否健全，租稅負擔是否合理，有無租稅障礙存在，為影響一國投資環境的重要因素之一。而評估稅制優劣的指標，可從稅收的適足性、租稅的公平性、租稅中立性及效率性、行政成本高低、納稅人的容忍程度等方面來評估。本研究計畫則主要從產業發展與企業需求導向出發，瞭解企業需要那樣的租稅環境，以及現行租稅環境有那些需要改善的地方，並且從優良稅制所具有的特性與指標來加以檢視。研究重點是從健全產業發展的賦稅環境來切入，同時兼顧對稅收之衝擊，基於整體成本效益的考量來評估。然而因研究經費及時間上的限制，故而本研究計畫主要著重在當前較迫切需要的四個子題來研究：
1.加值型營業稅改由進口時課徵對產業影響之改進建議。
2.高科技產業在科學園區內外租稅優惠差異之改進建議。
3.研究與發展支出提高投資抵減率之效果分析。
4.鼓勵大陸台商資金回流效果之研究。
每個子題主要分成「背景說明」、「問題剖析」、「建議事項」三段式來撰寫。在分析與建議事項之說明上，則詳實的包括有關實證文獻與數據、理論基礎、法規制度、國際經驗，並且彙整產、官、學專家訪談、座談與問卷調查之意見。最後，提出具體的結論與建議事項。