本中心源於經濟部國際貿易署於2003年起委託本院辦理「國際經貿事務研究及培訓中心」（簡稱WTO中心計畫），以因應台灣於2002年1月1日正式成為世界貿易組織（WTO）會員，帶動台灣經貿事務談判及研究動能、培育經貿談判人才之需求。近年來自由貿易協定（FTA）或區域經濟整合蔚為風潮，WTO中心在既有研究基礎上擴及至區域貿易協定（RTA），2013年起調整為「WTO及RTA中心」。本中心定位為支援WTO及RTA經貿談判之專業智庫，旨在深化WTO及RTA研究，提供政府參與國際經貿事務所需之經濟、法律、產業等各方面意見，包括中長期政策研究、即時經貿與法律諮詢，議題涵蓋關稅自由化、服務業貿易自由化、法規調和、非關稅措施等，同時也積極培養經貿談判人才、辦理國際經貿事務宣導及相關課程，以利台灣積極參與國際經貿事務，維護台灣經貿利益。